湖北农业科学 ›› 2018, Vol. 57 ›› Issue (7): 122-124.doi: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2018.07.029

• 生物工程 • 上一篇    下一篇

柽柳核基因组微卫星反应体系的建立和优化

曹建波, 张如华   

  1. 临沂大学生命科学学院,山东 临沂 276000
  • 收稿日期:2017-12-15 发布日期:2020-01-14
  • 通讯作者: 张如华(1970-),男,博士,讲师,主要从事园林植物育种和群体遗传学,(电子信箱)zhangruhua@lyu.edu.cn。
  • 作者简介:曹建波(1996-),男,安徽亳州人,在读本科生,研究方向为园林植物遗传育种,(电话)17806165659(电子信箱)879726687@qq.com;
  • 基金资助:
    临沂大学博士启动基金项目(2015B516)

Establishment and Optimization of gSSR-PCR Amplification System for Tamarix chinensis Lour.

CAO Jian-bo, ZHANG Ru-hua   

  1. College of Life Sciences Linyi University,Linyi 276000,Shandong,China
  • Received:2017-12-15 Published:2020-01-14

摘要: 柽柳(Tamarix chinensis Lour.)是耐盐碱的灌木或小乔木,多散生于河漫滩或在沿海滩涂形成大规模群体。对由Illumina测序开发的柽柳微卫星标记反应体系进行了正交试验设计,确定10 μL SSR-PCR反应体系的各反应物浓度为Mg2+ 0.8 mmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、Taq DNA聚合酶 0.5 U、引物0.5 μmol/L、模板DNA 20 ng。

关键词: 柽柳(Tamarix chinensis Lour.), 基因组微卫星, PCR反应体系, 正交试验

Abstract: Tamarix chinensis Lour. is a salt-tolerance shrub or small tree,scattered in the riverbed or forming large natural populations in coastal tidal areas. For population genetics study of this species,the orthogonal design was used to determine the PCR amplification system of genomic SSR derived from Illumina sequencing in T. chinensis. The 10 μL reaction system of gSSR is as follows:0.8 mmol/L Mg2+,0.25 mmol/L dNTPs,0.5 U Taq DNA polymerase,0.5 μmol/L primers,and 20 ng DNA.

Key words: Tamarix chinensis Lour., genomic microsatellites, PCR reaction system, orthogonal design

中图分类号: